Foundation ซีซั่น 2 ดำเนินเรื่องราวต่อจากซีซั่นแรก โดยติดตามกลุ่มนักลี้ภัยที่พยายามฟื้นฟูอารยธรรมหลังการล่มสลายของจักรวรรดิกาแลกติก พวกเขาต้องเผชิญกับความท้าทายที่ยิ่งใหญ่ขึ้นในการสร้างโลกใหม่ท่ามกลางซากปรักหักพังของอาณาจักรเก่า

ศูนย์กลางของเรื่องคือสถาบันสถาปนา องค์กรที่ก่อตั้งโดยนักวิทยาศาสตร์ผู้มุ่งมั่นรักษาความรู้ของมนุษยชาติและวางรากฐานสำหรับอนาคต เป้าหมายของพวกเขาคือการรวบรวมองค์ความรู้ทั้งหมดไว้ในสารานุกรม ซึ่งจะเป็นแนวทางในการสร้างอารยธรรมขึ้นใหม่

แต่เส้นทางสู่การฟื้นฟูนั้นเต็มไปด้วยอุปสรรค ทั้งจากผู้ที่ต้องการรักษาอำนาจเดิมและผู้ที่ไม่ต้องการเห็นการเปลี่ยนแปลง สมาชิกของสถาบันสถาปนาต้องต่อสู้ทั้งในด้านความรู้และการเมือง พวกเขาต้องเผชิญกับการหักหลังและจำเป็นต้องเสียสละ ท่ามกลางความพยายามในการสร้างอนาคตที่ดีกว่าสำหรับมนุษยชาติ

ซีซั่นนี้นำเสนอการต่อสู้อันเข้มข้นระหว่างความหวังกับความสิ้นหวัง ความรู้กับอวิชชา และการเปลี่ยนแปลงกับการยึดติดกับอดีต ในขณะที่ตัวละครพยายามนำพามนุษยชาติออกจากยุคมืด